生物滤池除臭原理是一种由碎石或塑料制品填充而成的生物处理结构，它是根据土壤自净原理，在污水灌溉实践的基础上，通过较原始的间歇砂滤池和接触滤池而发展起来的，其目的是使污水与填料表面生长的微生物膜间隙接触，使污水得到净化，这就是生物滤池除臭原理。

将一定数量的滤料放入生物滤池中，当尾气自上而下被过滤时，尾气与滤料不断接触，微生物便可在尾气表面繁殖再生，形成生物膜。生物膜是一种生态膜系统，由多种微生物组成，微生物从废气中吸收污染物作为营养物质，并通过代谢获取生存所需的能量，从而形成新的微生物群体。当生物膜达到一定厚度时，氧气无法进入生物膜内部，造成生物膜内部处于厌氧状态，粘附能力下降。水冲完后，生物膜脱落，新的生物膜在滤料上生长。废气经多次循环后得到净化。